Kao daroviti vezista, Ninković je karijeru seniora započeo u svom matičnom klubu - Čukaričkom. Nakon dve sezone u kojima je pokazao talenat, sa 20 godina se preselio u ukrajinskog velikana - Dinamo iz Kijeva. 

U Kijevu je proveo gotovo čitavu deceniju gde je prošao faze od prilagođavanja, dokazivanja umeća, agonija izazvanih povredama i gubitka minutaže, do ponovo sjajnih partija i novog gubitka poverenja od strane trenera što je na kraju dovelo do pozajmice francuskom prvoligašu Evijanu. Sve vreme, bio je u ili blizu nacionalnog tima Srbije za koji je debitovao 2009. godine.

Kao deklariasni Zvezdaš, više godina je trajalo nagađanje da će pojačati tim iz Ljutice Bogdana, a sve se ostvarilo tokom leta 2013. godine.

Ninkovićev intervju za "Utakmicu" možete pročitati ovde: