Poput najslavnijeg Nišlije u svetu fudbala, Dragana Stojkovića Piksija i Stojanović je sa Pasi Poljane. Još u podmlatku Radničkog su ga zapazili skauti slavnog PSV Ajndhovena i odveli ga među "Filipsovce", ipak nikada nije debitovao za crveno-bele.

U Holandskom klubu se našao sa 18 godina i igrao je do 2004. za podmladak i drugi tim PSV-a. Nakon toga, 2005. je zaigrao na pozajmicu za Ajndhoven, člana druge lige Holandije. Nakon jedne godine pozajmica je prerasla u puno članstvo Stojanovića u Ajndhovenu. Nakon druge sezone u tom timu, ofanzivni vezista je prešao u RBC Rozendal, za koji je igrao još dve godine u istom rangu.

2009. godine je prešao u Aris Limasol u kiparskoj prvoj ligi, nakon jedne solidne sezone prešao je u Hapoel Haifu i odigrao još jednu dobru sezonu. Naredne godine ponovo se obreo na Kipru, prešao je u Etnikos Ahnu, a leta 2012. se vratio svom matičnom klubu - Radničkom.

Od povratka na "Čair", ovaj odlično tehnički običeni vezista pruža standardno dobre partije u manevru i napadu.